世界首個(gè)野生梨基因組圖譜組裝完成

　　科技日?qǐng)?bào)北京8月6日電（記者瞿劍）據(jù)中國(guó)農(nóng)科院最新消息，該院果樹研究所與中科院遺傳與發(fā)育生物學(xué)研究所合作，完成了世界首個(gè)野生梨基因組圖譜的組裝，為梨功能基因挖掘、梨屬植物馴化及野生資源利用提供了重要信息。相關(guān)研究成果在線發(fā)表于國(guó)際權(quán)威學(xué)術(shù)期刊《植物生物技術(shù)（PlantBiotechnology Journal）》。

　　論文第一作者、中國(guó)農(nóng)科院果樹研究所董星光博士介紹，該項(xiàng)研究以山西杜梨為材料，結(jié)合PacBio三代測(cè)序、Bionano光學(xué)圖譜、Hi-C技術(shù)，杜梨基因組組裝大小為532.7兆，contigN50為1.57兆，共有59552個(gè)蛋白質(zhì)編碼基因和247.4兆重復(fù)序列被注釋，通過(guò)BUSCO對(duì)基因組完整性進(jìn)行評(píng)估，完整性達(dá)到95.9%。杜梨擴(kuò)張基因在次生代謝通路中顯著富集，可能進(jìn)而影響杜梨較強(qiáng)的逆境適應(yīng)性。同源基因比對(duì)分析結(jié)果顯示，東方梨馴化過(guò)程中果實(shí)大小、糖代謝和轉(zhuǎn)運(yùn)以及光合效率受到正向選擇。杜梨基因組中總共鑒定出573個(gè)NBS類型抗病基因，其中150個(gè)是TNL型抗病基因，在已發(fā)表的薔薇科基因組中數(shù)量最多，解釋了杜梨作為野生種的強(qiáng)抗病性。

　　他表示，梨屬植物在馴化過(guò)程中果實(shí)酸澀味逐漸消失。研究發(fā)現(xiàn)，杜梨原花青素合成結(jié)構(gòu)基因拷貝數(shù)顯著多于白梨，影響了原花青素的積累，同時(shí)花青素還原酶代謝途徑是原花青素合成的唯一途徑，山梨醇轉(zhuǎn)運(yùn)蛋白跨膜轉(zhuǎn)運(yùn)可能是影響可溶性有機(jī)物質(zhì)積累的主要因素。